本發明提供一種車隊停站與派遣的決策系統，其營運後台運算處理單元經配置以實施包含依據臨時叫車資訊決定執行固定車輛派遣演算法與非固定車輛派遣演算法的一者；依據派遣參數組執行固定車輛派遣演算法與非固定車輛派遣演算法的此者而產生對應站點的停站訊息，並依據停站訊息產生對應第一車輛的停靠站編號組；依據派遣參數組執行固定車輛派遣演算法與非固定車輛派遣演算法的此者而產生派遣訊息，並依據派遣訊息產生對應第二車輛的派遣車輛編號組。藉此，可應用於固定路徑運輸或非固定路徑運輸，並可根據載運需求進行營運模式的智慧切換。