本發明提供一種低溫儲貨裝置及其氫氣溫控系統，該氫氣供給系統包含膨脹閥、複數個溫控組及電控單元，各溫控組包含控制閥、熱交換器及溫度感測器，電控單元電性連接控制閥及溫度感測器，以該氫氣供給系統進行低溫儲貨裝置的分區控溫方法，先感測低溫儲貨裝置中，貨櫃內之容室的溫度，判斷容室的溫度與目標溫度的差異值是否介於處理範圍，以決定在氫氣經過膨脹閥而具有吸熱能力後，是否通過控制閥流經熱交換器，並藉由熱交換器與對應的容室進行熱交換，達到小幅度降溫、精準控溫的效果，能提升燃料電池應用於低溫貨櫃的成本效益。